More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3915 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 662 aa  1345    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  88.85 
 
 		 646 aa  1152    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  41.01 
 
 		 624 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  39.94 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  37.44 
 
 		 619 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  35.35 
 
 		 650 aa  308  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  34.56 
 
 		 659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 		 653 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  33.92 
 
 		 655 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  29.96 
 
 		 527 aa  187  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.95 
 
 		 1942 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 614 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.98 
 
 		 925 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 1005 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 		 599 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.17 
 
 		 1975 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 1017 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.06 
 
 		 1891 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.14 
 
 		 593 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.88 
 
 		 622 aa  140  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 838 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.94 
 
 		 1855 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.73 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  28.55 
 
 		 609 aa  130  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.75 
 
 		 600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.95 
 
 		 604 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  28.15 
 
 		 610 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.38 
 
 		 2068 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 723 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 528 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 576 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.47 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.82 
 
 		 885 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 		 836 aa  108  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 583 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  26.44 
 
 		 642 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 499 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  28.28 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.18 
 
 		 1021 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  24.45 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.72 
 
 		 584 aa  104  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 588 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.05 
 
 		 574 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  23.62 
 
 		 606 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.95 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.1 
 
 		 814 aa  99.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.48 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 524 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  24.89 
 
 		 686 aa  98.2  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  26.34 
 
 		 675 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.7 
 
 		 586 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  24.37 
 
 		 686 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.7 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  26.61 
 
 		 675 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.18 
 
 		 620 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  26.88 
 
 		 675 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.24 
 
 		 575 aa  95.5  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.7 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.7 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.7 
 
 		 586 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.7 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  26.61 
 
 		 675 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.46 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.46 
 
 		 586 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.75 
 
 		 490 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  23.95 
 
 		 1175 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  34.97 
 
 		 676 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 619 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.1 
 
 		 582 aa  94  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  26.52 
 
 		 676 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  26.52 
 
 		 676 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  22.49 
 
 		 815 aa  94  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  21.37 
 
 		 586 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  25.85 
 
 		 676 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 665 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  33.12 
 
 		 553 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 676 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  27.07 
 
 		 675 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  26.98 
 
 		 676 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  26.98 
 
 		 676 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 509 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.13 
 
 		 649 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  25.97 
 
 		 676 aa  91.3  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  34.36 
 
 		 676 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 914 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 586 aa  91.3  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  25.27 
 
 		 600 aa  90.9  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.32 
 
 		 566 aa  90.5  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  22.59 
 
 		 644 aa  90.5  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 578 aa  90.5  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  26.52 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 477 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  30.91 
 
 		 562 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 587 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  27.69 
 
 		 778 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>