272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2409 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 494 aa  1027    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  64.27 
 
 		 488 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  57.32 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  53.48 
 
 		 496 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  49.9 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  49.7 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  50.3 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  49.7 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  50.3 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  49.49 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  50.3 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  50.3 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  49.7 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  50.3 
 
 		 495 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  50.1 
 
 		 495 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  50.1 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  49.7 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  51.63 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  50.71 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  48.38 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  47.29 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  47.87 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  46.04 
 
 		 627 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  45.53 
 
 		 513 aa  445  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  45.33 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  45.55 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  44.92 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  44.72 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  44.51 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  44.72 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  47.37 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  44.51 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  44.33 
 
 		 480 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  45.64 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  44.62 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  43.06 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  38.74 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  37.47 
 
 		 516 aa  266  8.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  35.35 
 
 		 623 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  29.04 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  27.59 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.53 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  28.22 
 
 		 364 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  26.61 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.26 
 
 		 517 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  24.68 
 
 		 979 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.27 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.79 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 583 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  23 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.33 
 
 		 639 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  22.75 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.05 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  23.21 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.95 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  21.95 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.61 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.36 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  29.9 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  23.17 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  22.95 
 
 		 765 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.3 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  22.87 
 
 		 815 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  22.66 
 
 		 774 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.55 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.95 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  23.65 
 
 		 1527 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  21.35 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  25.95 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  23.21 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  20.49 
 
 		 853 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 778 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 522 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 		 595 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  23.41 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  22.75 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  22.73 
 
 		 665 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.6 
 
 		 614 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  26.94 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  20.6 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  19.92 
 
 		 767 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  22.58 
 
 		 600 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.24 
 
 		 1092 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.55 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  24.41 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 555 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  24.09 
 
 		 1100 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>