More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0214 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  100 
 
 		 552 aa  1142    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  37.41 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  37.06 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  37.06 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  37.12 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  37.06 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  36.88 
 
 		 558 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  38.15 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  36.88 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  36.17 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  36.65 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  36.88 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  36.88 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  37.06 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  36.94 
 
 		 562 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  35.32 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  37.06 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  37.52 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.08 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.91 
 
 		 556 aa  363  5.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.85 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.11 
 
 		 562 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  37.27 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  36.35 
 
 		 555 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.43 
 
 		 572 aa  360  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  37.43 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.74 
 
 		 560 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  36.77 
 
 		 622 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.49 
 
 		 561 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  36.65 
 
 		 568 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  36 
 
 		 578 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  36.36 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.35 
 
 		 554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.18 
 
 		 562 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  36.46 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  36.46 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  36.46 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  36.46 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.62 
 
 		 538 aa  350  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  36.28 
 
 		 554 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.04 
 
 		 560 aa  349  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.17 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  36.31 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.45 
 
 		 560 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.04 
 
 		 551 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.52 
 
 		 556 aa  348  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  35.99 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  35.12 
 
 		 570 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  34.23 
 
 		 557 aa  346  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  34.04 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  34.16 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  36.49 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  36.49 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  35.7 
 
 		 566 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.38 
 
 		 551 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.49 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.16 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  37.2 
 
 		 551 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  37.2 
 
 		 551 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.69 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  35.83 
 
 		 551 aa  341  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.2 
 
 		 551 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.38 
 
 		 551 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.2 
 
 		 551 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.2 
 
 		 551 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.31 
 
 		 551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  34.11 
 
 		 556 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  35.47 
 
 		 556 aa  339  8e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.21 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  35.47 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  35.28 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.02 
 
 		 550 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  35.28 
 
 		 554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.5 
 
 		 550 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.5 
 
 		 550 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.5 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  33.99 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  35.13 
 
 		 549 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  34.72 
 
 		 600 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.67 
 
 		 553 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.54 
 
 		 555 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.54 
 
 		 555 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  35.82 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  34.2 
 
 		 571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  35.55 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  34.99 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  36.43 
 
 		 639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  35.03 
 
 		 571 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  35.39 
 
 		 565 aa  327  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  35.17 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  34.09 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  33.68 
 
 		 577 aa  323  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  32.74 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.47 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  34.78 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.48 
 
 		 543 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  32.82 
 
 		 546 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>