More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2808 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  62.29 
 
 
492 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
481 aa  983    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  82.92 
 
 
480 aa  843    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  52.48 
 
 
513 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  52.07 
 
 
513 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  52.07 
 
 
513 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  52.27 
 
 
513 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  52.07 
 
 
513 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  51.65 
 
 
513 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  50.83 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  51.86 
 
 
513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  50.83 
 
 
483 aa  500  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  46.49 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  48.14 
 
 
483 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  45.55 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  47.48 
 
 
486 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  42.68 
 
 
627 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  44.21 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  43.7 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  43.7 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  43.7 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  43.7 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  44.15 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  43.6 
 
 
507 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  43.5 
 
 
494 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  42.02 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  41.82 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  42.02 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  42.02 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  42.02 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  42.02 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  43.29 
 
 
499 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  41.8 
 
 
496 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  40.85 
 
 
495 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  41.12 
 
 
472 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  40.49 
 
 
576 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  39.67 
 
 
623 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  38.25 
 
 
516 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  27.73 
 
 
442 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.62 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.76 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.1 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.72 
 
 
364 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.76 
 
 
447 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  22.2 
 
 
617 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.11 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  25.4 
 
 
646 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 
836 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  24.16 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  23.9 
 
 
532 aa  73.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  22.65 
 
 
617 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  23.64 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  24.16 
 
 
588 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 
662 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 
838 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.38 
 
 
979 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.06 
 
 
1891 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.1 
 
 
586 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.37 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  22.2 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 
1005 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  23.28 
 
 
655 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.37 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 
522 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  22.22 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.81 
 
 
1855 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  22.58 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.93 
 
 
815 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.03 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22 
 
 
410 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.78 
 
 
814 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 
650 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  21.08 
 
 
559 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.8 
 
 
1975 aa  64.3  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  22.75 
 
 
593 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 
659 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 
576 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  23 
 
 
591 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  22.33 
 
 
596 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  22.33 
 
 
596 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  22.33 
 
 
596 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 
528 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 
458 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.28 
 
 
586 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.28 
 
 
586 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  24.1 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  23.08 
 
 
589 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>