More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2110 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 439 aa  905    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  30.57 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  27.93 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  25.97 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.17 
 
 		 620 aa  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.06 
 
 		 623 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  25.28 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 914 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  29.08 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  26.67 
 
 		 605 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  33.16 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  33.87 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  32.06 
 
 		 722 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  31.1 
 
 		 722 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.96 
 
 		 510 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.36 
 
 		 532 aa  93.2  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 739 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.23 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.75 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.06 
 
 		 1021 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  27.92 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  27.94 
 
 		 552 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  31.89 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  28.77 
 
 		 707 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  28.64 
 
 		 661 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  23.33 
 
 		 688 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  27.22 
 
 		 589 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  29.11 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  24.84 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  35.46 
 
 		 679 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  25.08 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.58 
 
 		 2156 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  23.98 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  22.34 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.36 
 
 		 1891 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  31.21 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  23.85 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  25.87 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  24.63 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  25.72 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.62 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  23.78 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.22 
 
 		 979 aa  70.1  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  22.35 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  23.96 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  24.35 
 
 		 1888 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  27.41 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  28.63 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  23.69 
 
 		 599 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  27.02 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  23.16 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  25.21 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  29.02 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 814 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.7 
 
 		 1975 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  25.42 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.94 
 
 		 836 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  24.93 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  24.93 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  25.65 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  24.93 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.35 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  22.3 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  24.93 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  23.42 
 
 		 2638 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  23.33 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  29.57 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.22 
 
 		 1942 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.28 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.19 
 
 		 885 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  21.94 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.31 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  23.75 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  31.21 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  29.38 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.01 
 
 		 2068 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.06 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.86 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.08 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>