More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2452 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  50.43 
 
 		 733 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  51.14 
 
 		 733 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  51.18 
 
 		 735 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  50.57 
 
 		 733 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  50.72 
 
 		 733 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  50.43 
 
 		 733 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  50.89 
 
 		 752 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  50.89 
 
 		 752 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  51.04 
 
 		 752 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2452  glycogen operon protein  100 
 
 		 689 aa  1415    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  49.27 
 
 		 708 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  50.15 
 
 		 750 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  50.23 
 
 		 716 aa  612  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  48.61 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  47.08 
 
 		 739 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  48.91 
 
 		 739 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  45.37 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 		 723 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  50.75 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  46.44 
 
 		 779 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  47.13 
 
 		 708 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  45.38 
 
 		 738 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  49.46 
 
 		 720 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  48.14 
 
 		 722 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  46.3 
 
 		 757 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  44.71 
 
 		 693 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  45.09 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  47.95 
 
 		 711 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.69 
 
 		 720 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  48.51 
 
 		 704 aa  551  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  47.89 
 
 		 698 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  45.01 
 
 		 738 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  46.91 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  47.01 
 
 		 712 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  47.44 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  45.64 
 
 		 719 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  47.66 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  47.47 
 
 		 755 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.64 
 
 		 755 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  45.34 
 
 		 721 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  47.55 
 
 		 661 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  46.27 
 
 		 754 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  46.86 
 
 		 712 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  47.46 
 
 		 704 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  46.32 
 
 		 714 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  45.59 
 
 		 712 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  47.78 
 
 		 706 aa  542  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  45.21 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  46.89 
 
 		 704 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.79 
 
 		 751 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  46.72 
 
 		 721 aa  545  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  44.78 
 
 		 758 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  44.78 
 
 		 758 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  44.3 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  45.35 
 
 		 701 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  43.73 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  48.96 
 
 		 694 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  47.57 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  49.59 
 
 		 701 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  44.49 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  46.75 
 
 		 708 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  49.12 
 
 		 694 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  44.22 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  47.26 
 
 		 730 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  49.12 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  49.09 
 
 		 700 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  46.33 
 
 		 713 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  47.47 
 
 		 745 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  45.34 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  50.43 
 
 		 729 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0515  glycogen debranching protein GlgX  47.23 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  46.48 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  48.34 
 
 		 715 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.21 
 
 		 704 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  47.99 
 
 		 704 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  48.44 
 
 		 723 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  45.52 
 
 		 721 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  47.84 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  48.42 
 
 		 701 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.63 
 
 		 716 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.24 
 
 		 707 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  47.63 
 
 		 716 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  47.7 
 
 		 718 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  43.48 
 
 		 733 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  43.67 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  48.76 
 
 		 688 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  43.89 
 
 		 691 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  45.27 
 
 		 719 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 710 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.22 
 
 		 727 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  46.56 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  46.54 
 
 		 709 aa  529  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  48.76 
 
 		 688 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  42.51 
 
 		 720 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  46.56 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  46.56 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 709 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  45.59 
 
 		 703 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>