135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3370 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  100 
 
 		 470 aa  978    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  58.7 
 
 		 466 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  49.25 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  46.33 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  47.41 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  41.41 
 
 		 441 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  30.66 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  33.63 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  28.08 
 
 		 605 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  29.75 
 
 		 563 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  29.72 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  34.88 
 
 		 661 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  25.37 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 613 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.55 
 
 		 2156 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  23.89 
 
 		 750 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  26.9 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  28.77 
 
 		 688 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  23.89 
 
 		 750 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  28.78 
 
 		 914 aa  103  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  26.79 
 
 		 707 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 738 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  26.81 
 
 		 679 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  28.53 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  28.12 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  27.78 
 
 		 722 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.47 
 
 		 1888 aa  89.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  28.26 
 
 		 589 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  26.82 
 
 		 528 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  25.5 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  25.83 
 
 		 722 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  26.35 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.47 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  22.9 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  23.7 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.83 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.92 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 649 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  22.83 
 
 		 814 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  24.82 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  24.82 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  25 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  25 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  22.69 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  23.65 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  20.11 
 
 		 885 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  21.16 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.45 
 
 		 642 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  23.02 
 
 		 572 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  26.24 
 
 		 693 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  23.31 
 
 		 553 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 739 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  23.72 
 
 		 1142 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  21.07 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 570 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  31.71 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.95 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  23.88 
 
 		 1108 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  29.27 
 
 		 706 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  36.9 
 
 		 924 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  29.27 
 
 		 708 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  39.34 
 
 		 694 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 694 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.06 
 
 		 696 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.87 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  35.71 
 
 		 924 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 694 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  19.46 
 
 		 878 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  19.46 
 
 		 878 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.05 
 
 		 630 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 593 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  23.83 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 539 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 624 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 541 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  30.25 
 
 		 979 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  22.69 
 
 		 576 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  22.05 
 
 		 1100 aa  47  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  28.95 
 
 		 576 aa  46.6  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 		 640 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  24.59 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  27.72 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  26.02 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1129  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 767 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0646165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.05 
 
 		 727 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  22.07 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  24.85 
 
 		 774 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  21.94 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0100  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 802 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  27.75 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>