More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0100 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0100  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 802 aa  1666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1129  alpha amylase catalytic region  59.49 
 
 		 767 aa  892    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0646165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  36.54 
 
 		 710 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  35.77 
 
 		 708 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  35.58 
 
 		 726 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  35.99 
 
 		 701 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  33.29 
 
 		 845 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  35.72 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  34.15 
 
 		 720 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  34.2 
 
 		 720 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  34.71 
 
 		 715 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  33.97 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  34.43 
 
 		 756 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  34.46 
 
 		 722 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  34.25 
 
 		 706 aa  365  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  35.4 
 
 		 710 aa  364  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  34.21 
 
 		 701 aa  364  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  35.89 
 
 		 727 aa  363  8e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  34.25 
 
 		 713 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  33.56 
 
 		 719 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  33.73 
 
 		 711 aa  361  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  33.73 
 
 		 711 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  34.89 
 
 		 712 aa  360  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  35.25 
 
 		 714 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  35.88 
 
 		 714 aa  360  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  34.17 
 
 		 720 aa  360  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  34.17 
 
 		 722 aa  360  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  34.17 
 
 		 720 aa  360  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  34.57 
 
 		 758 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  34.97 
 
 		 714 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  34.57 
 
 		 758 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  34.97 
 
 		 714 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  33.79 
 
 		 730 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  34.59 
 
 		 779 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  34.45 
 
 		 720 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.38 
 
 		 1464 aa  357  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  34.44 
 
 		 755 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  33.69 
 
 		 706 aa  357  6.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  33.07 
 
 		 716 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  35.64 
 
 		 691 aa  356  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  32.73 
 
 		 719 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  34.91 
 
 		 779 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  34.05 
 
 		 691 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  33.42 
 
 		 723 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  33.79 
 
 		 718 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  34.05 
 
 		 691 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  34.05 
 
 		 691 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  34.05 
 
 		 691 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  34.16 
 
 		 715 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  33.47 
 
 		 719 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  33.89 
 
 		 717 aa  353  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  33.56 
 
 		 721 aa  353  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  34.03 
 
 		 738 aa  353  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  33.29 
 
 		 716 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  34.4 
 
 		 755 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  33.84 
 
 		 718 aa  352  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  33.86 
 
 		 733 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  35.23 
 
 		 700 aa  351  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  34.79 
 
 		 695 aa  352  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  32.56 
 
 		 720 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  34.25 
 
 		 757 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  35.05 
 
 		 717 aa  350  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  32.52 
 
 		 717 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  33.73 
 
 		 788 aa  350  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  34.6 
 
 		 721 aa  350  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  32.48 
 
 		 709 aa  350  7e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  36.52 
 
 		 711 aa  350  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  32.32 
 
 		 712 aa  349  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  34.46 
 
 		 706 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  34.76 
 
 		 733 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  32.65 
 
 		 717 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  34.42 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  32.65 
 
 		 717 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  32.52 
 
 		 717 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  34.78 
 
 		 704 aa  348  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  32.86 
 
 		 723 aa  347  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1670  glycogen debranching enzyme GlgX  33.78 
 
 		 686 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00650022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  34.02 
 
 		 710 aa  347  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  32.59 
 
 		 721 aa  347  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  33.12 
 
 		 721 aa  347  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  32.94 
 
 		 738 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  33.17 
 
 		 728 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  34.93 
 
 		 1537 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  34.34 
 
 		 752 aa  344  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  33.46 
 
 		 708 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  33.87 
 
 		 733 aa  342  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  32.65 
 
 		 712 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  31.44 
 
 		 704 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  34.14 
 
 		 718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  33.47 
 
 		 720 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  34.13 
 
 		 711 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  33.07 
 
 		 745 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  34.78 
 
 		 701 aa  337  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  32.04 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  34.99 
 
 		 709 aa  335  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  32.1 
 
 		 716 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  31.95 
 
 		 712 aa  334  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  32.24 
 
 		 729 aa  333  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  33.24 
 
 		 707 aa  333  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  33.75 
 
 		 708 aa  333  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>