122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2478 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 612 aa  1261    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  53.94 
 
 		 596 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  51.71 
 
 		 563 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  56.38 
 
 		 661 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  46.8 
 
 		 589 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  46.78 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  44.8 
 
 		 605 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  45.78 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  44.95 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.38 
 
 		 2156 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  46.26 
 
 		 688 aa  349  7e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 614 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  42.95 
 
 		 914 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 494 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  41.21 
 
 		 679 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  38.69 
 
 		 722 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  37.44 
 
 		 738 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  38.65 
 
 		 722 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.7 
 
 		 1888 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  38.36 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  35.81 
 
 		 707 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  38.7 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  28.3 
 
 		 449 aa  122  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.08 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.39 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  29.78 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  52.08 
 
 		 644 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  27.51 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 627 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.23 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  47.47 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.73 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  29.57 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.56 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  38.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.24 
 
 		 490 aa  67  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 1010 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  20.97 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  38.1 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  36.73 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.37 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.55 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24.62 
 
 		 572 aa  62  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  35.42 
 
 		 881 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  34.04 
 
 		 882 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.04 
 
 		 882 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  34.04 
 
 		 881 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.07 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 522 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  35.05 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  20.13 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  36.71 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 526 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 		 258 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 499 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.83 
 
 		 807 aa  51.6  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  27.68 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  21.71 
 
 		 836 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  30.11 
 
 		 661 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.48 
 
 		 1891 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 544 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  29.02 
 
 		 642 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 557 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  28.78 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  29.2 
 
 		 583 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.34 
 
 		 885 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 		 543 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.48 
 
 		 515 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.28 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.28 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  36.96 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  36.96 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  26.7 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  27.81 
 
 		 716 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  36.96 
 
 		 759 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  25.58 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  19.03 
 
 		 649 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  28.12 
 
 		 725 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  27.45 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 547 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>