22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1048 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  99.35 
 
 		 750 aa  1270    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  98.69 
 
 		 613 aa  1264    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 613 aa  1279    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  97.55 
 
 		 750 aa  1248    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  26.78 
 
 		 449 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  26.05 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  26.48 
 
 		 466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  24.14 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.81 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  21.07 
 
 		 707 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  21.82 
 
 		 1888 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  19.73 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.52 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  22.31 
 
 		 596 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.05 
 
 		 739 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  21.41 
 
 		 605 aa  43.9  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>