109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001376 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  81.25 
 
 		 449 aa  770    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  100 
 
 		 449 aa  933    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  61.9 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  49.25 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  46.15 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  43.92 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  32.26 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  28.09 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  31.28 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  30.79 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  27.52 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  29.21 
 
 		 605 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  25.34 
 
 		 750 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  26.13 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 612 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  24.84 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 614 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  26.05 
 
 		 613 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  26.05 
 
 		 613 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 914 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  27.7 
 
 		 688 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  26.86 
 
 		 661 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  26.74 
 
 		 596 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 566 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 738 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.27 
 
 		 2156 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  26.97 
 
 		 679 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  24.72 
 
 		 707 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  24.69 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  27.38 
 
 		 494 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  26.99 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  25.23 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  23.25 
 
 		 722 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  23.45 
 
 		 1888 aa  79.7  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  22.17 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  22.49 
 
 		 722 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  22.81 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.84 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  20.89 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  20.61 
 
 		 739 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.99 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  20 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  22.54 
 
 		 885 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.58 
 
 		 623 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.02 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  20.95 
 
 		 1193 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  20.67 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  21.14 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  27.23 
 
 		 568 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  21.33 
 
 		 651 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 1401 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  20.88 
 
 		 493 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 1401 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  29.03 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  28.28 
 
 		 640 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  29.33 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.65 
 
 		 620 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  30.19 
 
 		 979 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  20.06 
 
 		 814 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  35.96 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  35 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  35 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.25 
 
 		 1847 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  35 
 
 		 553 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  24.13 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  22.85 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  21.43 
 
 		 517 aa  46.6  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.72 
 
 		 576 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  22.52 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.27 
 
 		 642 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  22.26 
 
 		 644 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  22.33 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  29.52 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  25.32 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  21.06 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  22.03 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  23.88 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 643 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  21.81 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  20.93 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  28.92 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  31.2 
 
 		 723 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 767 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  33.71 
 
 		 576 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  23.59 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  22.4 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 		 593 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 1307 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.25 
 
 		 554 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 582 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>