110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1289 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  100 
 
 		 458 aa  956    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  61.9 
 
 		 449 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  65.78 
 
 		 449 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  47.41 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  46.21 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  40.55 
 
 		 441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  31.31 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  32.22 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  32.36 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  27.84 
 
 		 605 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  28.1 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  25.96 
 
 		 750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  26.2 
 
 		 661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  25.58 
 
 		 750 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  25.12 
 
 		 563 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  26.34 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 914 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  25.81 
 
 		 613 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  29.73 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 613 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  25.98 
 
 		 707 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  24.44 
 
 		 551 aa  93.6  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  25.06 
 
 		 679 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.52 
 
 		 2156 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.64 
 
 		 1888 aa  87.8  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  26.08 
 
 		 589 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  23.09 
 
 		 738 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  25.58 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  23.48 
 
 		 722 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  23.66 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  22.3 
 
 		 722 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24.48 
 
 		 559 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.72 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  26.63 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.99 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  24.73 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.73 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 623 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  22.36 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.31 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.73 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  28.08 
 
 		 640 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  22.27 
 
 		 561 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 672 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  22.53 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  23.5 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  26.67 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  30.61 
 
 		 570 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  26.23 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  23.5 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 557 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  23.37 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  36.59 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  21.34 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 836 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  20.8 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  33.33 
 
 		 553 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  27.17 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  21.84 
 
 		 814 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  22.72 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  22.2 
 
 		 606 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  22.2 
 
 		 606 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  21.9 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  31.58 
 
 		 580 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 		 539 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.08 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.13 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  25.46 
 
 		 1145 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.01 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  29.22 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  20.78 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.4 
 
 		 642 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  23.01 
 
 		 610 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  28.48 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  27.91 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  25.84 
 
 		 752 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  20.31 
 
 		 606 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  29 
 
 		 576 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  24.87 
 
 		 538 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  24.48 
 
 		 627 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  27.72 
 
 		 608 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 555 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 		 555 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>