139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05253 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  100 
 
 		 449 aa  931    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  81.25 
 
 		 449 aa  770    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  65.78 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  47.06 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  46.33 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  44.03 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  33.01 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  32.11 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.54 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  32.11 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  28.81 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  27.09 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  28.67 
 
 		 605 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 		 614 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  27.71 
 
 		 612 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  26.46 
 
 		 750 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  26.05 
 
 		 750 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  26.78 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  26.78 
 
 		 613 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  27.15 
 
 		 688 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  27.02 
 
 		 914 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  32.77 
 
 		 661 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  30.16 
 
 		 596 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.01 
 
 		 2156 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  25.27 
 
 		 679 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  25.34 
 
 		 589 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  27.99 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 738 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.51 
 
 		 1888 aa  93.2  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  24.15 
 
 		 707 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  24.95 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  24.04 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  29.33 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.07 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  28.71 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.99 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  32.08 
 
 		 979 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.21 
 
 		 739 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.71 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  19.45 
 
 		 511 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  22.99 
 
 		 614 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.01 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  22.39 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  27.92 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 540 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 1307 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.13 
 
 		 553 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  29.26 
 
 		 543 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.84 
 
 		 555 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.84 
 
 		 555 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  20.73 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  20.23 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  25.68 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  35.9 
 
 		 1401 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.19 
 
 		 600 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  24.55 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  27.72 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 		 1401 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  21.94 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  22.5 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.08 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  20.83 
 
 		 651 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  28.57 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  22.51 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  20.71 
 
 		 814 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  24.04 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 576 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  26.57 
 
 		 640 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.89 
 
 		 620 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 593 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24.34 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  22.7 
 
 		 703 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  21.32 
 
 		 488 aa  46.6  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  23.9 
 
 		 566 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 557 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  23.94 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  23.91 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  36.99 
 
 		 722 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  26.17 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  25.68 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  31.58 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  34.52 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  21 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  21.5 
 
 		 587 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  24.93 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  33.71 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  22.22 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  32.58 
 
 		 576 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>