More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0573 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  100 
 
 		 566 aa  1176    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  49.28 
 
 		 553 aa  541  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  36.62 
 
 		 676 aa  290  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  36.38 
 
 		 676 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  36.38 
 
 		 676 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  35.16 
 
 		 694 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  36.19 
 
 		 676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  36.19 
 
 		 676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  36.19 
 
 		 676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  36.38 
 
 		 676 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  36.19 
 
 		 676 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  35.35 
 
 		 687 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  35.82 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  34.75 
 
 		 687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  34.75 
 
 		 687 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  34.57 
 
 		 687 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  34.82 
 
 		 688 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  34.9 
 
 		 676 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  33.11 
 
 		 631 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  34.12 
 
 		 686 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  33.89 
 
 		 675 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  33.52 
 
 		 686 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  34.26 
 
 		 675 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  34.08 
 
 		 675 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  33.89 
 
 		 675 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  33.89 
 
 		 675 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  32.73 
 
 		 690 aa  257  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  27.25 
 
 		 554 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.38 
 
 		 609 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 528 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.16 
 
 		 1021 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  25.84 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.8 
 
 		 2638 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.85 
 
 		 752 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.05 
 
 		 1891 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 1005 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  31.27 
 
 		 599 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.75 
 
 		 1942 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25.5 
 
 		 614 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.39 
 
 		 593 aa  124  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.69 
 
 		 925 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.97 
 
 		 1855 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  27.33 
 
 		 762 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  30.69 
 
 		 484 aa  117  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  29.18 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.34 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 914 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.68 
 
 		 1975 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.52 
 
 		 622 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 838 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.61 
 
 		 2068 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 1017 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 836 aa  112  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  23.71 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 583 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.45 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.04 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  24.24 
 
 		 665 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.59 
 
 		 885 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 589 aa  104  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.74 
 
 		 739 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.04 
 
 		 620 aa  103  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  23.38 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.46 
 
 		 623 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.5 
 
 		 586 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.28 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  22.31 
 
 		 814 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 576 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.28 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 703 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 723 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  22.61 
 
 		 586 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.61 
 
 		 586 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.06 
 
 		 586 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  22.61 
 
 		 586 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.61 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.06 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.43 
 
 		 586 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.52 
 
 		 532 aa  95.5  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.07 
 
 		 586 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.77 
 
 		 586 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 786 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 587 aa  94.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 		 815 aa  94  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.7 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  31.22 
 
 		 665 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 742 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 588 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 		 646 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.68 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  21.85 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 650 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  22.24 
 
 		 586 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  28.73 
 
 		 765 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  28.73 
 
 		 774 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>