More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2966 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 554 aa  1148    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  35.14 
 
 		 694 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  34.86 
 
 		 688 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  34.61 
 
 		 687 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  34.61 
 
 		 687 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  34.43 
 
 		 687 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  34.15 
 
 		 675 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  34.15 
 
 		 675 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  34.15 
 
 		 675 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  33.98 
 
 		 675 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  33.8 
 
 		 675 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  33.8 
 
 		 676 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  33.86 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  33.74 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  33.86 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  33.74 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  33.74 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  33.51 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  33.57 
 
 		 676 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  33.51 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  32.64 
 
 		 676 aa  276  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  32.79 
 
 		 687 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  30.63 
 
 		 690 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  31.58 
 
 		 686 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  30.57 
 
 		 686 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 631 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  27.25 
 
 		 566 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  35.71 
 
 		 2638 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.64 
 
 		 599 aa  89.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 481 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  34.92 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  31.25 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.78 
 
 		 1005 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.79 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  37.98 
 
 		 622 aa  74.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  33.88 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 1017 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  22.61 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  32.03 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.3 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.33 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  35.66 
 
 		 1942 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.23 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  23.83 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.47 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  35.25 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  33.86 
 
 		 925 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.61 
 
 		 1891 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  33.82 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  33.82 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  33.82 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  31.93 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  31.93 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.59 
 
 		 1855 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  27.61 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  32.2 
 
 		 433 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  32.2 
 
 		 433 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  35.29 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  22.56 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  32.2 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  31.45 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.43 
 
 		 1975 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  27.56 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  30.25 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  21.81 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  33.61 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  28.21 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  22.45 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  29.92 
 
 		 703 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 853 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.05 
 
 		 624 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.25 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  31.54 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  22.72 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  21.55 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  32.79 
 
 		 654 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  30.47 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.96 
 
 		 838 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  23.18 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.37 
 
 		 2068 aa  60.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  30.14 
 
 		 774 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>