More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1270 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  97.68 
 
 
431 aa  870    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  100 
 
 
433 aa  890    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  95.15 
 
 
433 aa  851    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  95.36 
 
 
431 aa  849    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  95.84 
 
 
433 aa  857    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  95.15 
 
 
433 aa  851    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  90.95 
 
 
431 aa  812    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  90.49 
 
 
431 aa  813    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  95.13 
 
 
431 aa  847    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  87.96 
 
 
453 aa  790    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  62.36 
 
 
440 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 
510 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  41.39 
 
 
511 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.63 
 
 
574 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.59 
 
 
588 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  22.79 
 
 
589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 
635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  22.38 
 
 
586 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 
582 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.88 
 
 
472 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 
586 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 
587 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.08 
 
 
586 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32.07 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  37.75 
 
 
836 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  35.22 
 
 
609 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  40.44 
 
 
838 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
562 aa  93.2  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 
486 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.39 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  37.8 
 
 
686 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  35.77 
 
 
593 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  21.88 
 
 
762 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  37.8 
 
 
686 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  31.9 
 
 
481 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  33.82 
 
 
481 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  38.05 
 
 
610 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  37.21 
 
 
600 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  36.09 
 
 
665 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  35.62 
 
 
665 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  33.06 
 
 
599 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  41.03 
 
 
524 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  35.66 
 
 
814 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  37.4 
 
 
526 aa  86.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  32.88 
 
 
690 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  31.94 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  36.09 
 
 
686 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  34.53 
 
 
1942 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.82 
 
 
1891 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  34.88 
 
 
622 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  37.3 
 
 
925 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.09 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  33.74 
 
 
1021 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  39.45 
 
 
583 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  37.7 
 
 
1017 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  35.2 
 
 
1005 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  34.42 
 
 
605 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  40.98 
 
 
620 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  24.58 
 
 
675 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  33.08 
 
 
654 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  29.73 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  29.69 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  21.96 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.13 
 
 
1975 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.19 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  24.58 
 
 
675 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  21.19 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  24.58 
 
 
675 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.973795 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28 
 
 
559 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  30.94 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  24.58 
 
 
675 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  24.58 
 
 
675 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  33.82 
 
 
614 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  29.31 
 
 
533 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  30.41 
 
 
617 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 
622 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  30.19 
 
 
631 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  34.42 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  30.61 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  33.57 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  34.85 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  33.77 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  26.39 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  33.77 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  34.85 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  33.77 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  27.34 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  33.77 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  26.39 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  33.77 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  33.77 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  27.34 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  35.88 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  26.39 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>