More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1060 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  88.79 
 
 		 431 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  88.79 
 
 		 431 aa  786    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  87.96 
 
 		 433 aa  790    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  87.04 
 
 		 433 aa  783    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  87.38 
 
 		 431 aa  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  87.5 
 
 		 433 aa  787    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 453 aa  924    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  87.04 
 
 		 433 aa  783    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  87.15 
 
 		 431 aa  778    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  87.15 
 
 		 431 aa  778    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  62.59 
 
 		 440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  40.92 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  41.19 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 838 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 587 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.12 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.39 
 
 		 586 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.48 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  22.7 
 
 		 635 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 582 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.25 
 
 		 586 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.02 
 
 		 586 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  21.63 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.53 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 562 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  22.17 
 
 		 575 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  38.41 
 
 		 836 aa  96.7  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 1021 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  31.15 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32.42 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  33.12 
 
 		 609 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  37.4 
 
 		 593 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.35 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  22.75 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  36.88 
 
 		 686 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  37.32 
 
 		 686 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  35.77 
 
 		 599 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  32.37 
 
 		 646 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 		 614 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.11 
 
 		 486 aa  90.1  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  32.34 
 
 		 686 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  37.21 
 
 		 600 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  21.23 
 
 		 762 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  36.57 
 
 		 814 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  39.83 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 662 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  34.69 
 
 		 665 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  35.37 
 
 		 665 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  21.72 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  32.65 
 
 		 620 aa  88.2  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  36.51 
 
 		 1942 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  21.81 
 
 		 610 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  37.17 
 
 		 610 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  37.19 
 
 		 1005 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  39.86 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.33 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  35.04 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  21.35 
 
 		 610 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  34.11 
 
 		 622 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  37.3 
 
 		 925 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  39.45 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  37.7 
 
 		 1017 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  33.83 
 
 		 654 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  22.73 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  30.46 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.96 
 
 		 1891 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  38.6 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  31.62 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  32.19 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  33.03 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  23.06 
 
 		 622 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  40.16 
 
 		 620 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  35.51 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 624 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  30.14 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  33.1 
 
 		 786 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  31.78 
 
 		 885 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  33.12 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  28.77 
 
 		 617 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  32.28 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  33.08 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  28.12 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  25.53 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  25.53 
 
 		 675 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  25.53 
 
 		 675 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>