More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0875 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
440 aa  907    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  62.59 
 
 
453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  62.36 
 
 
433 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  62.12 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  62.36 
 
 
433 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  61.66 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  61.1 
 
 
431 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  61.89 
 
 
433 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  61.95 
 
 
431 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  61.89 
 
 
433 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  61.89 
 
 
431 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  37.52 
 
 
510 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 
511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 
524 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.6 
 
 
582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 
635 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 
477 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.91 
 
 
574 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 
588 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 
583 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
589 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.75 
 
 
575 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  22.63 
 
 
496 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.43 
 
 
586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.43 
 
 
586 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.27 
 
 
586 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 
838 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.27 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 
663 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  21.86 
 
 
586 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  22.05 
 
 
586 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  22.05 
 
 
586 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.05 
 
 
586 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  24.53 
 
 
587 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  21.83 
 
 
586 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.27 
 
 
586 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  34.75 
 
 
593 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  32.76 
 
 
609 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  36.23 
 
 
836 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  40.52 
 
 
814 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  31.82 
 
 
599 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  21.79 
 
 
586 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  30.13 
 
 
686 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.04 
 
 
562 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  32.53 
 
 
486 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 
586 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.39 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  36.64 
 
 
600 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  22.06 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  30.13 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  35.38 
 
 
622 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  31.53 
 
 
484 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  31.69 
 
 
1942 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.79 
 
 
1021 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  31.16 
 
 
559 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  36.13 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  32.14 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  33.33 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.92 
 
 
1891 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  31.82 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  21.83 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  33.59 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  31.97 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  31.61 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.77 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  31.17 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.17 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.09 
 
 
2068 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  30 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  29.52 
 
 
1017 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  32.84 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  30.13 
 
 
605 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  32.31 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  32.03 
 
 
885 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  33.59 
 
 
739 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  31.18 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  35.04 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  33.58 
 
 
665 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  33.87 
 
 
1005 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.09 
 
 
606 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  33.58 
 
 
665 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  36.8 
 
 
925 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  31.08 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  31.4 
 
 
786 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  27.57 
 
 
607 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  28.87 
 
 
687 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  28.87 
 
 
687 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  22.69 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  28.87 
 
 
687 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  29.41 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>