More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0252 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 436 aa  877    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  31.4 
 
 		 493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 510 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.77 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 488 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 481 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  29.62 
 
 		 586 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 		 588 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  28.71 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  29.44 
 
 		 582 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.93 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 		 487 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.93 
 
 		 586 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 574 aa  146  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.21 
 
 		 586 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.08 
 
 		 586 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  27.32 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.97 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.97 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.97 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.97 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  24.77 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.65 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.24 
 
 		 610 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 496 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 486 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.16 
 
 		 610 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.23 
 
 		 584 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.37 
 
 		 610 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  28.82 
 
 		 486 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.43 
 
 		 575 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  29.04 
 
 		 815 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 635 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 541 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 663 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 622 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.89 
 
 		 545 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 576 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.1 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  26.77 
 
 		 606 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  24.2 
 
 		 715 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.44 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.48 
 
 		 574 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  24.7 
 
 		 608 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.06 
 
 		 481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 474 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.94 
 
 		 589 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.92 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 649 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.29 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 814 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.78 
 
 		 1193 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.45 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.53 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 703 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.12 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  23.52 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.47 
 
 		 836 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  23.88 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 659 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 576 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  24.69 
 
 		 580 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 634 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 674 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.54 
 
 		 654 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 1401 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.09 
 
 		 509 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  26.41 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  21.86 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  23.27 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 		 588 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  23.63 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  23.67 
 
 		 537 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  22.92 
 
 		 682 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 569 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  24.87 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  25.25 
 
 		 600 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>