More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001087 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  86.06 
 
 		 540 aa  976    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  100 
 
 		 537 aa  1117    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 588 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 582 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  29.11 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  28.4 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.05 
 
 		 574 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.44 
 
 		 586 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.44 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.9 
 
 		 610 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  24.08 
 
 		 610 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.78 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.11 
 
 		 575 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.08 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.08 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.08 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.17 
 
 		 610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  24.08 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 838 aa  117  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.78 
 
 		 586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.89 
 
 		 1891 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.88 
 
 		 586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.1 
 
 		 472 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.9 
 
 		 2068 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  24.15 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  23.86 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 481 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.06 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 663 aa  107  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 528 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 836 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  26.53 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 528 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 487 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 1299 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  27.11 
 
 		 762 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 589 aa  103  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  22.55 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 481 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  24.11 
 
 		 1401 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 1401 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  23.96 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  25.16 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 		 619 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.54 
 
 		 620 aa  99.4  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 814 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.24 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.54 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.43 
 
 		 1847 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 436 aa  97.4  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 583 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  32.61 
 
 		 584 aa  96.7  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 486 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  30.65 
 
 		 574 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  23.86 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 		 683 aa  93.6  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.73 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 575 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  25.24 
 
 		 562 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  22.94 
 
 		 622 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  25.48 
 
 		 591 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  31.8 
 
 		 480 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25.06 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.04 
 
 		 577 aa  90.9  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 562 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26 
 
 		 567 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  43.55 
 
 		 686 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  35.26 
 
 		 1942 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  23.23 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  24.25 
 
 		 574 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.94 
 
 		 1021 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  25.9 
 
 		 601 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.59 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  34.9 
 
 		 1005 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  24.63 
 
 		 580 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.47 
 
 		 545 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.47 
 
 		 885 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.78 
 
 		 515 aa  88.2  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 639 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  42.74 
 
 		 686 aa  87  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>