More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  100 
 
 		 464 aa  908    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  59.41 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  58.73 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  58.73 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  56.22 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  56.59 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  56.72 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  55.53 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  55.66 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  59.75 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  50.86 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  48.56 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  47 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  37.56 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  32.2 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  28.45 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  31.32 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  28.51 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.95 
 
 		 575 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  28.73 
 
 		 481 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 663 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 586 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  28.41 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 589 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  29.14 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  32.47 
 
 		 644 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.89 
 
 		 586 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.89 
 
 		 586 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  29.36 
 
 		 586 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 588 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  30.26 
 
 		 586 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  29.9 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.71 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.08 
 
 		 586 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  31.4 
 
 		 586 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  31.4 
 
 		 586 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  31.4 
 
 		 586 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  31.4 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  31.1 
 
 		 586 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  28.7 
 
 		 610 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  29.72 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 		 610 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.75 
 
 		 574 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.5 
 
 		 589 aa  153  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  28.86 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 		 635 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  26.72 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.14 
 
 		 584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31.49 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  27.27 
 
 		 574 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  28.73 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 578 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 562 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 622 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  28.29 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.46 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.91 
 
 		 515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  23.64 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 914 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.93 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  29.1 
 
 		 541 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.9 
 
 		 1401 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 1307 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 1401 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  26.24 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  28.52 
 
 		 606 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 545 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  27.3 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  27.38 
 
 		 607 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  31.33 
 
 		 703 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.59 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  26.39 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 541 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  28.14 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  29 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  26.73 
 
 		 609 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 		 659 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  28.5 
 
 		 609 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  31.77 
 
 		 580 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.63 
 
 		 567 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  26.91 
 
 		 539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.79 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  27.63 
 
 		 538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>