More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0054 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  69.15 
 
 		 676 aa  986    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  69.3 
 
 		 676 aa  987    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  69.3 
 
 		 676 aa  989    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 688 aa  1421    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  69.3 
 
 		 676 aa  987    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  69.3 
 
 		 676 aa  987    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  67.49 
 
 		 675 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  67.35 
 
 		 675 aa  953    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  69.3 
 
 		 676 aa  988    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  54.86 
 
 		 694 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  78.89 
 
 		 687 aa  1120    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  68.57 
 
 		 676 aa  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  79.04 
 
 		 687 aa  1127    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  78.89 
 
 		 687 aa  1126    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  69.44 
 
 		 676 aa  989    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  67.49 
 
 		 675 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  66.91 
 
 		 675 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  69.15 
 
 		 676 aa  986    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  67.06 
 
 		 675 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  69.27 
 
 		 676 aa  979    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  57.04 
 
 		 687 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  45.97 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  44.22 
 
 		 686 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  44.55 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  51.14 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  34.86 
 
 		 554 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  34.88 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  34.82 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  32.81 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 		 528 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 		 528 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.84 
 
 		 2638 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 752 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.46 
 
 		 1891 aa  144  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 1005 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.57 
 
 		 1942 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 		 1017 aa  134  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.79 
 
 		 1021 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.59 
 
 		 586 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.8 
 
 		 925 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.56 
 
 		 1975 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25.56 
 
 		 609 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 836 aa  125  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.33 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.01 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.67 
 
 		 620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.3 
 
 		 593 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.08 
 
 		 1855 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  24.06 
 
 		 838 aa  117  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.31 
 
 		 599 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.44 
 
 		 2068 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.45 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.02 
 
 		 885 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 614 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  22.91 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 814 aa  110  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  42.96 
 
 		 622 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.01 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.02 
 
 		 586 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.37 
 
 		 589 aa  102  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 639 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  26.04 
 
 		 609 aa  101  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.71 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 		 742 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.56 
 
 		 484 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.05 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.05 
 
 		 586 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  22.37 
 
 		 606 aa  98.6  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  24.43 
 
 		 484 aa  98.2  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.43 
 
 		 490 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  25.56 
 
 		 584 aa  97.4  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  22.34 
 
 		 576 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 665 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 624 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.6 
 
 		 532 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 481 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.24 
 
 		 493 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  39.26 
 
 		 686 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.13 
 
 		 552 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  36.36 
 
 		 524 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 878 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 878 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  39.26 
 
 		 665 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 586 aa  94.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  33.51 
 
 		 641 aa  94.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 		 654 aa  94.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 587 aa  93.6  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.01 
 
 		 559 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  21.78 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  21.78 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  21.78 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 649 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  21.78 
 
 		 586 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>