More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5156 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 631 aa  1285    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  53.69 
 
 		 687 aa  505  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  47.93 
 
 		 694 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  51.39 
 
 		 676 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  51.39 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  51.14 
 
 		 688 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  50.89 
 
 		 675 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  51.2 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  51.39 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  51.39 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  50.89 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  50.76 
 
 		 687 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  51.39 
 
 		 676 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  49.46 
 
 		 687 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  50.69 
 
 		 675 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  51.2 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  50.89 
 
 		 675 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  50.76 
 
 		 687 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  50.69 
 
 		 675 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  50.3 
 
 		 676 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  50.6 
 
 		 676 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  50.4 
 
 		 676 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  44.57 
 
 		 690 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  44.57 
 
 		 686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  44.91 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  33.46 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  33.11 
 
 		 566 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  31.16 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.51 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.8 
 
 		 528 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  31.65 
 
 		 533 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.32 
 
 		 2638 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  29.27 
 
 		 752 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 		 1021 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.99 
 
 		 2068 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.33 
 
 		 1855 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.47 
 
 		 600 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 614 aa  120  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.3 
 
 		 1891 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.67 
 
 		 1942 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 599 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  24.79 
 
 		 1005 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 1017 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 622 aa  110  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25.9 
 
 		 609 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 1643 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.8 
 
 		 604 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 510 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 		 925 aa  107  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 		 484 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.51 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.8 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.92 
 
 		 1975 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.39 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 586 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 477 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 914 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.31 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.31 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 		 814 aa  97.8  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.21 
 
 		 586 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.12 
 
 		 575 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 589 aa  97.4  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.51 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.51 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.51 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 836 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.38 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.29 
 
 		 620 aa  95.5  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  24.31 
 
 		 586 aa  95.1  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.68 
 
 		 885 aa  94.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 576 aa  94.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.98 
 
 		 574 aa  94.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  25.29 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 703 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 838 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  24.04 
 
 		 586 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 526 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.34 
 
 		 587 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  24.59 
 
 		 484 aa  90.9  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  22.66 
 
 		 600 aa  90.5  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  22.28 
 
 		 606 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 496 aa  87.8  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.92 
 
 		 642 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 588 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.58 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.52 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.21 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>