More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0587 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 552 aa  1122    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  45.78 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  42.46 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  40.91 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  40.95 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  40.83 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  41.52 
 
 		 579 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  39.93 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  39.6 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  40.65 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  41.75 
 
 		 1102 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  41.62 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  39.57 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  42.07 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  41.37 
 
 		 554 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  40.84 
 
 		 1088 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  41.04 
 
 		 1088 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  40.24 
 
 		 1092 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  40.66 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  41.04 
 
 		 1088 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  41.06 
 
 		 1100 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  41.16 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  39.06 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  42.11 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40.76 
 
 		 1102 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  40.11 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  39.48 
 
 		 1115 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  41.48 
 
 		 548 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40.76 
 
 		 1102 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  40.73 
 
 		 1110 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  40.32 
 
 		 1123 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  41.47 
 
 		 1130 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  37.75 
 
 		 1154 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  41.49 
 
 		 554 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1160 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  42.17 
 
 		 1139 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  40.75 
 
 		 1100 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  38.06 
 
 		 1098 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  38.6 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  42.41 
 
 		 1111 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  38.73 
 
 		 1100 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  39.92 
 
 		 1119 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  37.07 
 
 		 1113 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 		 1138 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  41.81 
 
 		 1100 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  39.84 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  39.16 
 
 		 1152 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  37.61 
 
 		 551 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  39.56 
 
 		 1154 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  39.2 
 
 		 1108 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  40.96 
 
 		 1093 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  40.96 
 
 		 1093 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  39.56 
 
 		 1121 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  39.09 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  37.36 
 
 		 1085 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  40.76 
 
 		 1136 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  39.52 
 
 		 1142 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  40.95 
 
 		 1099 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  38.95 
 
 		 1095 aa  369  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.56 
 
 		 1104 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  40.76 
 
 		 1112 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  40.36 
 
 		 1100 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  37.98 
 
 		 1106 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  40.16 
 
 		 1137 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  38.04 
 
 		 1094 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  39.96 
 
 		 1137 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  40.16 
 
 		 1137 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  40.16 
 
 		 1137 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  40.16 
 
 		 1137 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  37.77 
 
 		 1164 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  37.77 
 
 		 1164 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  38.96 
 
 		 1109 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  39.64 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  39.28 
 
 		 1105 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  40.24 
 
 		 1100 aa  364  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  38.84 
 
 		 1100 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  37.75 
 
 		 1105 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  37.43 
 
 		 1106 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  40 
 
 		 1110 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  37.43 
 
 		 1106 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  38.49 
 
 		 583 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.44 
 
 		 591 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  39.76 
 
 		 1131 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  39.76 
 
 		 1131 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  39.76 
 
 		 1131 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  39.76 
 
 		 1131 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  39.76 
 
 		 1131 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  40.24 
 
 		 1108 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  38.76 
 
 		 1101 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  38.55 
 
 		 1105 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  39.45 
 
 		 1098 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  39.64 
 
 		 1109 aa  360  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  39.56 
 
 		 1131 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  39.74 
 
 		 1114 aa  359  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  40.52 
 
 		 1098 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  36.84 
 
 		 1108 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  39.01 
 
 		 1113 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  36.41 
 
 		 1108 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>