More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2421 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  55.26 
 
 		 637 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  56.25 
 
 		 607 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 593 aa  1215    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  47.06 
 
 		 590 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.49 
 
 		 623 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.95 
 
 		 653 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  31.35 
 
 		 648 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  35.73 
 
 		 560 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  31.54 
 
 		 729 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  30.83 
 
 		 742 aa  237  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  30.93 
 
 		 729 aa  236  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  30.54 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  32.26 
 
 		 740 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  31.71 
 
 		 746 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.26 
 
 		 734 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  30.5 
 
 		 730 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  29.01 
 
 		 754 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  31.71 
 
 		 745 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  30.67 
 
 		 765 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  32.42 
 
 		 1320 aa  225  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  33.1 
 
 		 712 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  29.37 
 
 		 754 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  31.54 
 
 		 745 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  28.91 
 
 		 754 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  31.93 
 
 		 740 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  29.9 
 
 		 754 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  31.27 
 
 		 745 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.37 
 
 		 650 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  30.88 
 
 		 726 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  31.23 
 
 		 695 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  32.12 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.15 
 
 		 739 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  31.71 
 
 		 745 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  31.32 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.28 
 
 		 731 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  31.6 
 
 		 743 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  29.37 
 
 		 759 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  31.67 
 
 		 716 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  31.32 
 
 		 743 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.66 
 
 		 646 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.18 
 
 		 728 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  31.43 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  32.69 
 
 		 716 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  31.17 
 
 		 728 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  31.3 
 
 		 748 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.43 
 
 		 731 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  30.03 
 
 		 638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  32 
 
 		 738 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  28.78 
 
 		 749 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  30.05 
 
 		 755 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.8 
 
 		 726 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  30.98 
 
 		 722 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.98 
 
 		 735 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.38 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  30.05 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.92 
 
 		 621 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  31.98 
 
 		 712 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  31.13 
 
 		 749 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.98 
 
 		 732 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  29.9 
 
 		 731 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.5 
 
 		 784 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  31.68 
 
 		 728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 		 732 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  31.22 
 
 		 749 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.69 
 
 		 841 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.55 
 
 		 633 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  31 
 
 		 755 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.66 
 
 		 639 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  32.04 
 
 		 716 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  31.63 
 
 		 716 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  30.93 
 
 		 740 aa  213  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.34 
 
 		 784 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.55 
 
 		 785 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  31.93 
 
 		 725 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.79 
 
 		 631 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  31.11 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  31.11 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  31.55 
 
 		 743 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  29.13 
 
 		 764 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  31.25 
 
 		 735 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  31.36 
 
 		 735 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  30.67 
 
 		 1224 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  30.43 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  31.16 
 
 		 727 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  32.11 
 
 		 725 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  30.65 
 
 		 741 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.53 
 
 		 768 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.29 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  32.12 
 
 		 737 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.65 
 
 		 732 aa  210  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  31.18 
 
 		 741 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  27.04 
 
 		 659 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  30.73 
 
 		 736 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  31.47 
 
 		 728 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  29.98 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  31.06 
 
 		 736 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.22 
 
 		 635 aa  209  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>