174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0985 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 605 aa  1246    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  52.54 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  45.87 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  45.58 
 
 		 589 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  47.5 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  44.78 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  50.21 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  43.58 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  40.79 
 
 		 722 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  45.59 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  44.49 
 
 		 688 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  43.01 
 
 		 679 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  40.57 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  40.42 
 
 		 722 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  38.09 
 
 		 738 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  44.38 
 
 		 661 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  43.04 
 
 		 707 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  44.47 
 
 		 914 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  39.72 
 
 		 528 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  38.74 
 
 		 551 aa  308  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.17 
 
 		 2156 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  36.87 
 
 		 1888 aa  296  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  30.48 
 
 		 441 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  31.88 
 
 		 461 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  29.21 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  31.41 
 
 		 453 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  27.77 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  28.67 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  28.19 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  28.08 
 
 		 470 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.65 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.84 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.57 
 
 		 739 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.92 
 
 		 642 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.4 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  22.39 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  38.24 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  40.13 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.64 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  23.4 
 
 		 627 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  37.19 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2137  glycoside hydrolase starch-binding  39.81 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24.91 
 
 		 559 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.68 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.22 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  38.24 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.7 
 
 		 1891 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  23.25 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  35.58 
 
 		 881 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.58 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1331  hypothetical protein  39.77 
 
 		 753 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  21.52 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  38.46 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.76 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  24.79 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  23.08 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.99 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  22.87 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  23.05 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 925 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  29.56 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  43.24 
 
 		 644 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  24.27 
 
 		 2638 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  22.22 
 
 		 549 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  24.61 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  21.65 
 
 		 516 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 		 433 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  21.39 
 
 		 750 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.77 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.77 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  25.51 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  21.76 
 
 		 750 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 554 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.37 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  23.63 
 
 		 623 aa  53.9  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  21.58 
 
 		 413 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  22.79 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 499 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.14 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  23.56 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  24.75 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 		 647 aa  51.2  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 593 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  22.61 
 
 		 553 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  29.86 
 
 		 559 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  23.48 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 552 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>