More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  100 
 
 		 477 aa  946    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  47.21 
 
 		 464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  45.25 
 
 		 442 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  45.17 
 
 		 441 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  46.19 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  46.19 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  45.47 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  47.17 
 
 		 413 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  45.96 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  46.12 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  44.17 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 413 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  42.13 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  31.16 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.84 
 
 		 589 aa  143  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  29.39 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  30.05 
 
 		 481 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  28.98 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 589 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.78 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.78 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.93 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.73 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.85 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 574 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  28.82 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 663 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 1307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  28.82 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.6 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 575 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.59 
 
 		 586 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.5 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.5 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.06 
 
 		 610 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.79 
 
 		 600 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 588 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  27.35 
 
 		 606 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 914 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  25.63 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.97 
 
 		 574 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  26.91 
 
 		 644 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 635 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 483 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  29.29 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 583 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.23 
 
 		 584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 655 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.42 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  27.29 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 576 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  24.86 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.31 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 1401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  27.75 
 
 		 608 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.53 
 
 		 1401 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  22.73 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  27.03 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  30.97 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  27.59 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  27.32 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  24.28 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 575 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  27.59 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  25.63 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 588 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  28.9 
 
 		 558 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 582 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  23.58 
 
 		 524 aa  106  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  25.71 
 
 		 1093 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 1847 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  27.06 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  27.06 
 
 		 605 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>