More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8729 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 441 aa  883    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  61.56 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  58.65 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  55.31 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  56.72 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  56.92 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  54.81 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  56.92 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  56.92 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  52.25 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  56.75 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 413 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  45.17 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  38.4 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  33.25 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  33.73 
 
 		 472 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.57 
 
 		 587 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  29.28 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  30.32 
 
 		 610 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  28.82 
 
 		 486 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  29.72 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 589 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  29.45 
 
 		 610 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 		 586 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  30.09 
 
 		 583 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.95 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.37 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.37 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.37 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.37 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  28.35 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  30.15 
 
 		 481 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.16 
 
 		 586 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.16 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.53 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.74 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.53 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  29.92 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.3 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  28.67 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 644 aa  143  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  27.98 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  30.95 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  35.51 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 		 582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  27.19 
 
 		 663 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.4 
 
 		 914 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  30.73 
 
 		 586 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  24.95 
 
 		 524 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.21 
 
 		 606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  25.82 
 
 		 475 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 576 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  33.99 
 
 		 576 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.15 
 
 		 584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  31.61 
 
 		 1401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  29.49 
 
 		 727 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  31.64 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 622 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 1401 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 		 541 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.82 
 
 		 1145 aa  123  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  26.52 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  26.91 
 
 		 1193 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  32.26 
 
 		 588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  31.69 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  28.7 
 
 		 600 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  32.51 
 
 		 545 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.79 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  27.13 
 
 		 1175 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  27.1 
 
 		 651 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 1307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.22 
 
 		 642 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  28.18 
 
 		 608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.71 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  25.7 
 
 		 605 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  23.32 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.6 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  26.48 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 575 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  28.09 
 
 		 715 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 		 558 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  22.11 
 
 		 552 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>