28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0314 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1331    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  52.08 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  49.02 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  42.86 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  44.21 
 
 		 555 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  45.24 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  41.25 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  36 
 
 		 703 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  36.61 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  47.95 
 
 		 738 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 1010 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  51.35 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  41.33 
 
 		 679 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 767 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  43.24 
 
 		 605 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  29.03 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  33.78 
 
 		 881 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  29.91 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 753 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.76 
 
 		 882 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  32.76 
 
 		 882 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  32.76 
 
 		 881 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  32.43 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  25.88 
 
 		 544 aa  47.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  28.92 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>