22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3116 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1080    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  67.17 
 
 		 548 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  41.76 
 
 		 560 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1878  hypothetical protein  36.67 
 
 		 635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154844  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1719  hypothetical protein  28.38 
 
 		 644 aa  83.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0944619  decreased coverage  0.0039153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15281  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1938  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  27.31 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  59.62 
 
 		 843 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4764  hypothetical protein  33.01 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  30.2 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2262  hypothetical protein  30.8 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.12 
 
 		 1987 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.65 
 
 		 1657 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  25.88 
 
 		 644 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  29.93 
 
 		 171 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  29.93 
 
 		 171 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  27.63 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  26.54 
 
 		 197 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  26.54 
 
 		 197 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  30.25 
 
 		 290 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  40.38 
 
 		 1414 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>