21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3117 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 548 aa  1083    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  66.18 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  40.93 
 
 		 560 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1878  hypothetical protein  33.95 
 
 		 635 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154844  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1719  hypothetical protein  29.43 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0944619  decreased coverage  0.0039153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1938  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  25.6 
 
 		 593 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4764  hypothetical protein  33.66 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  61.54 
 
 		 843 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15281  hypothetical protein  30.41 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2262  hypothetical protein  32.02 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  29.22 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.36 
 
 		 1090 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.67 
 
 		 1462 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  44.23 
 
 		 1657 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.14 
 
 		 1414 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1987 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  25.52 
 
 		 184 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.88 
 
 		 1059 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  25.53 
 
 		 197 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  25.53 
 
 		 197 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.21 
 
 		 440 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>