91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2938 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2938  ATPase  100 
 
 		 563 aa  1177    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  51.45 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  50.99 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  44.76 
 
 		 589 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  46.75 
 
 		 661 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  43.87 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  41.33 
 
 		 605 aa  369  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  42.18 
 
 		 679 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  45.95 
 
 		 914 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  42.45 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  41.72 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  37.94 
 
 		 722 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  44.55 
 
 		 470 aa  336  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  41.7 
 
 		 494 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 614 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  36.19 
 
 		 722 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  34.01 
 
 		 738 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  39.3 
 
 		 707 aa  303  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  37.24 
 
 		 528 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.31 
 
 		 2156 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  34.42 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.75 
 
 		 1888 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  30.57 
 
 		 461 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  33.08 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.52 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.09 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  29.75 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.12 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  30.61 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.87 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  49.02 
 
 		 644 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  50 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  31.89 
 
 		 439 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 703 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.7 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 		 1010 aa  57  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  22.55 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.97 
 
 		 881 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 649 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  26.13 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.5 
 
 		 642 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 767 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  23.55 
 
 		 701 aa  51.6  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 882 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.97 
 
 		 609 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  25.82 
 
 		 686 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  28.57 
 
 		 881 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 882 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.09 
 
 		 559 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.73 
 
 		 1021 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  25.82 
 
 		 686 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 741 aa  50.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  27.74 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  26.72 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  36.49 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  27.01 
 
 		 677 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.79 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  25.86 
 
 		 532 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  25 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  27.74 
 
 		 677 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 614 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  30.63 
 
 		 218 aa  48.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  26.52 
 
 		 689 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.33 
 
 		 410 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.21 
 
 		 1891 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  28.8 
 
 		 691 aa  47  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.03 
 
 		 462 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  28.57 
 
 		 668 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  22.19 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 385 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 742 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.84 
 
 		 586 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  29.74 
 
 		 700 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  28.85 
 
 		 701 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  25.81 
 
 		 660 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  25.9 
 
 		 708 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.15 
 
 		 517 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 511 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>