More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2083 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 555 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  55.93 
 
 		 579 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  57.56 
 
 		 554 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 541 aa  1122    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  57.56 
 
 		 554 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  57.67 
 
 		 553 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  76.44 
 
 		 540 aa  885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  57.01 
 
 		 554 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  57.49 
 
 		 553 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  57.3 
 
 		 553 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  55.9 
 
 		 554 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  53.33 
 
 		 570 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  50.28 
 
 		 544 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  50.74 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  48.15 
 
 		 556 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  48.7 
 
 		 552 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  48.82 
 
 		 564 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  46.21 
 
 		 521 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  46.67 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  44.79 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  46.48 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  47.45 
 
 		 563 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  46.53 
 
 		 559 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  46.35 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  46.32 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  46.35 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  41.85 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  42.25 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  40.96 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  42.35 
 
 		 1102 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  42.35 
 
 		 1102 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  41.38 
 
 		 1100 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  41.6 
 
 		 1102 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  41.3 
 
 		 1088 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  43.65 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  41.74 
 
 		 1101 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  41.7 
 
 		 1093 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  41.92 
 
 		 1100 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  41.04 
 
 		 1098 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  42.1 
 
 		 1137 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  41.65 
 
 		 1093 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  40.78 
 
 		 1114 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  41.08 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  40.77 
 
 		 1088 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  41.08 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  40.52 
 
 		 1092 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  41.08 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  40.89 
 
 		 1131 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  40.73 
 
 		 1121 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  41.33 
 
 		 1098 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  40.77 
 
 		 1088 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1123 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  41.08 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  41.27 
 
 		 1100 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  41.91 
 
 		 1137 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  41.2 
 
 		 1100 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  41.08 
 
 		 1121 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  41.04 
 
 		 1115 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  40.59 
 
 		 1088 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  41.08 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  40.8 
 
 		 1098 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  40.44 
 
 		 1152 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  44.08 
 
 		 1108 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.52 
 
 		 1138 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  41.14 
 
 		 1100 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1113 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  40.76 
 
 		 1108 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  40.56 
 
 		 1136 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  40.74 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  41.09 
 
 		 1100 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  41.53 
 
 		 1099 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  40.22 
 
 		 1088 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  41.06 
 
 		 1110 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  39.37 
 
 		 1088 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  44.44 
 
 		 1106 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1160 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  40.19 
 
 		 1137 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  40.47 
 
 		 1113 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  41.14 
 
 		 1098 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  40.11 
 
 		 1094 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  41.83 
 
 		 964 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  40.87 
 
 		 1101 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  44.44 
 
 		 1106 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  44.86 
 
 		 1106 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1164 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  40.19 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1164 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  42.39 
 
 		 1116 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  40.19 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  40.44 
 
 		 1154 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  40.41 
 
 		 1105 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  39.85 
 
 		 1061 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  39.37 
 
 		 1085 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  42.19 
 
 		 1116 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  40.22 
 
 		 1100 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  40.26 
 
 		 1154 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  44.12 
 
 		 1105 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.93 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  43.63 
 
 		 1108 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>