23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1319 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  60.95 
 
 
1888 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  61.54 
 
 
551 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  51.89 
 
 
470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  43.4 
 
 
566 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  44.34 
 
 
688 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  45.28 
 
 
589 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  44.76 
 
 
914 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  45.28 
 
 
679 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  39.81 
 
 
479 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  40.13 
 
 
605 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  35.43 
 
 
722 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  29.67 
 
 
707 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  37.5 
 
 
722 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  38 
 
 
738 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  34.78 
 
 
661 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 
494 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  35.58 
 
 
528 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  33.93 
 
 
596 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  36.11 
 
 
614 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  31.48 
 
 
563 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.86 
 
 
2156 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>