221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1927 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 914 aa  1876    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  52.7 
 
 		 688 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  56.29 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  53.15 
 
 		 566 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  45.32 
 
 		 679 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.7 
 
 		 1888 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  48.96 
 
 		 589 aa  416  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  45.49 
 
 		 596 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  43.03 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  48.34 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  45.95 
 
 		 563 aa  343  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  43.18 
 
 		 605 aa  337  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  41.09 
 
 		 707 aa  337  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  42.08 
 
 		 661 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  42.95 
 
 		 612 aa  331  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  40.35 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  39.79 
 
 		 722 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  41.88 
 
 		 528 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  40.3 
 
 		 494 aa  314  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  41.88 
 
 		 722 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 		 614 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.92 
 
 		 2156 aa  276  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  30.31 
 
 		 458 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 		 461 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  33.45 
 
 		 453 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  32.87 
 
 		 453 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  28.06 
 
 		 449 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.02 
 
 		 449 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.11 
 
 		 458 aa  105  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  27.52 
 
 		 466 aa  104  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  33.77 
 
 		 997 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  28.78 
 
 		 470 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  28.95 
 
 		 441 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 439 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  44.76 
 
 		 218 aa  92.8  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.5 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.07 
 
 		 620 aa  67  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 703 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.41 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.28 
 
 		 1891 aa  64.7  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.11 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  31.76 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.33 
 
 		 559 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.38 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  29.01 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  29.13 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 		 521 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 509 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 742 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.56 
 
 		 649 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  34.04 
 
 		 722 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  27.07 
 
 		 456 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.59 
 
 		 511 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 484 aa  57  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 		 1021 aa  57  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  32 
 
 		 733 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.91 
 
 		 426 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 		 524 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  21.35 
 
 		 814 aa  55.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  29.63 
 
 		 736 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  29.63 
 
 		 736 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  22.32 
 
 		 469 aa  54.7  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  29.63 
 
 		 736 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  30.86 
 
 		 736 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  25.56 
 
 		 716 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.7 
 
 		 526 aa  54.3  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  29.13 
 
 		 716 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  27.68 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  26.44 
 
 		 441 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  31.76 
 
 		 750 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  23.33 
 
 		 739 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  25.09 
 
 		 516 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 510 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  28.25 
 
 		 731 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  31.91 
 
 		 748 aa  52.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.25 
 
 		 741 aa  52.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  22.34 
 
 		 765 aa  52.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  30.37 
 
 		 725 aa  52  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 575 aa  52  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  30.37 
 
 		 725 aa  52  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  21.33 
 
 		 480 aa  52  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  27.13 
 
 		 749 aa  51.6  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  24.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  28.37 
 
 		 555 aa  51.6  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.11 
 
 		 629 aa  51.2  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.77 
 
 		 464 aa  51.2  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.85 
 
 		 822 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  34.69 
 
 		 759 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  29.7 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  34.69 
 
 		 759 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 595 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.13 
 
 		 1942 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  27.75 
 
 		 755 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 736 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  29.27 
 
 		 743 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  31.73 
 
 		 737 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  28.37 
 
 		 555 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>