More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3374 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  97.57 
 
 
453 aa  918    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
453 aa  937    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  54.3 
 
 
458 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  49.89 
 
 
461 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  31.64 
 
 
466 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  32.11 
 
 
449 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  33.63 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  30.79 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  32.22 
 
 
458 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  29.88 
 
 
441 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  29.89 
 
 
661 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  28.65 
 
 
563 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  30.82 
 
 
679 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.17 
 
 
2156 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  30.05 
 
 
566 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  28.64 
 
 
596 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  28.64 
 
 
688 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  26.94 
 
 
707 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 
612 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  31.45 
 
 
605 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  31.71 
 
 
589 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  32.87 
 
 
914 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  28.01 
 
 
551 aa  120  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  30.28 
 
 
470 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  28.92 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  31.83 
 
 
722 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  29.73 
 
 
528 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  31.83 
 
 
722 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.06 
 
 
1888 aa  103  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  33.16 
 
 
439 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 
614 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  31.22 
 
 
738 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.39 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
521 aa  83.2  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  28.25 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  32.34 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  29.57 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.93 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  28.68 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  25.61 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.24 
 
 
1891 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.53 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 
555 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  28.8 
 
 
555 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  30.59 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  31.07 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  31.88 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  30.51 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  26.67 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.21 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  34.06 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.99 
 
 
572 aa  73.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.03 
 
 
606 aa  73.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.03 
 
 
606 aa  73.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 
576 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.1 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.21 
 
 
2638 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.79 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  24.84 
 
 
576 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.38 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.79 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0498  alpha amylase domain-containing protein  26.6 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.0360992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  31.21 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 
507 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  27.34 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  30.61 
 
 
558 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  27.23 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.8 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  25.82 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  23.49 
 
 
750 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.56 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  29.48 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  29.51 
 
 
554 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  27.39 
 
 
752 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 
683 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  25.73 
 
 
600 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  29.38 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  32.7 
 
 
687 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  29.73 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  29.5 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>