65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2859 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  100 
 
 		 661 aa  1381    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  57.86 
 
 		 596 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  56.38 
 
 		 612 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  46.75 
 
 		 563 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  44.49 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  44.79 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  45.55 
 
 		 605 aa  354  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  42.5 
 
 		 479 aa  350  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  42.04 
 
 		 470 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  42.08 
 
 		 914 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.85 
 
 		 2156 aa  330  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  41.99 
 
 		 679 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  40.68 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  38.99 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  38.58 
 
 		 738 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  37.34 
 
 		 707 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.45 
 
 		 1888 aa  276  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  37.61 
 
 		 551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  65.78 
 
 		 607 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  35.06 
 
 		 722 aa  270  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  37.72 
 
 		 528 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  35.69 
 
 		 722 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  29.89 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  30.59 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  32.47 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 		 461 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  34.88 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  26.86 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.2 
 
 		 458 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  32.77 
 
 		 449 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  27.61 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  25.64 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.05 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  34.78 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  25.98 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.45 
 
 		 526 aa  67  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.7 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.36 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.45 
 
 		 814 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  28.12 
 
 		 552 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.02 
 
 		 532 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.22 
 
 		 642 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.64 
 
 		 836 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.04 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 524 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.21 
 
 		 1021 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 499 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.85 
 
 		 572 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  27.03 
 
 		 427 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.37 
 
 		 468 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  28.09 
 
 		 742 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.2 
 
 		 925 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.09 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.09 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.73 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  22.85 
 
 		 838 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.68 
 
 		 729 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  23.27 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.6 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  25.12 
 
 		 732 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  25.12 
 
 		 732 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>