More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3935 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  49.24 
 
 
737 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.42 
 
 
736 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  49.66 
 
 
736 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  46.26 
 
 
732 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  47.79 
 
 
712 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.15 
 
 
736 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.9 
 
 
735 aa  702    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  48.39 
 
 
740 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  47.79 
 
 
775 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.01 
 
 
736 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  48.03 
 
 
732 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.56 
 
 
730 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.15 
 
 
741 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  47.9 
 
 
768 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 
732 aa  697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  47.93 
 
 
712 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  83.17 
 
 
741 aa  1270    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.47 
 
 
741 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  52.66 
 
 
621 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  61.56 
 
 
749 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.25 
 
 
755 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  49.12 
 
 
750 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.58 
 
 
737 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50 
 
 
740 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  47.21 
 
 
716 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  48.35 
 
 
716 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  47 
 
 
764 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  52.7 
 
 
750 aa  798    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  47.04 
 
 
749 aa  700    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  46.82 
 
 
743 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 
733 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 
728 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 
735 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  45.58 
 
 
764 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  45.73 
 
 
765 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  53.48 
 
 
638 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  50.14 
 
 
726 aa  717    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  46.61 
 
 
763 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  44.25 
 
 
754 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  45.85 
 
 
774 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 
746 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  46.08 
 
 
736 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 
728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 
740 aa  703    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 
727 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  48.06 
 
 
834 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  63.72 
 
 
812 aa  918    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  49.11 
 
 
716 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.87 
 
 
760 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.57 
 
 
784 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  47.6 
 
 
735 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  46.29 
 
 
729 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.39 
 
 
755 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  47.93 
 
 
716 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  49.31 
 
 
725 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.73 
 
 
785 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 
716 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  45.82 
 
 
745 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  47.74 
 
 
716 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.82 
 
 
732 aa  849    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  49.12 
 
 
736 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  100 
 
 
759 aa  1556    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 
722 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 
748 aa  690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.11 
 
 
631 aa  661    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  99.6 
 
 
759 aa  1551    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  48.79 
 
 
725 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50 
 
 
738 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.8 
 
 
728 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  49.72 
 
 
727 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  45.74 
 
 
743 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  79.42 
 
 
731 aa  1203    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 
727 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  44.95 
 
 
776 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.29 
 
 
728 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.3 
 
 
747 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.48 
 
 
695 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  63.01 
 
 
755 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  48.58 
 
 
733 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  45.87 
 
 
743 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  46.79 
 
 
732 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.38 
 
 
728 aa  731    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  58.77 
 
 
1224 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  48.99 
 
 
736 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  44.98 
 
 
756 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.22 
 
 
770 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  46.48 
 
 
723 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  47.92 
 
 
728 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.15 
 
 
736 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  61.96 
 
 
727 aa  917    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 
731 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  55.79 
 
 
749 aa  820    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.27 
 
 
841 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  100 
 
 
759 aa  1556    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  48.23 
 
 
727 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  84.71 
 
 
737 aa  1276    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.03 
 
 
631 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  54.75 
 
 
640 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  45.87 
 
 
743 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  44.23 
 
 
754 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>