119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1247 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 494 aa  1022    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  50.22 
 
 		 605 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  45.22 
 
 		 596 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  46.82 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  45.18 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  43.42 
 
 		 589 aa  362  9e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  42.32 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  42.26 
 
 		 470 aa  356  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  43.01 
 
 		 722 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  45.07 
 
 		 566 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  40.17 
 
 		 738 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  43.3 
 
 		 679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 612 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  40.62 
 
 		 688 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  41.48 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  38.72 
 
 		 661 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  40.93 
 
 		 707 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 914 aa  326  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  42.37 
 
 		 722 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.44 
 
 		 1888 aa  278  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  35.85 
 
 		 551 aa  269  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.93 
 
 		 2156 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 		 453 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  24.95 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  25.11 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.38 
 
 		 449 aa  90.1  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  31.28 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  24.36 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.76 
 
 		 642 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  38.32 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  31.94 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  23.88 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.07 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.42 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.31 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  25.74 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.21 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  27.1 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.91 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.67 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  24.29 
 
 		 1021 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.6 
 
 		 814 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 838 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.39 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.45 
 
 		 462 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 258 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 624 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 493 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  26.49 
 
 		 607 aa  50.4  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.81 
 
 		 2638 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.17 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  30.1 
 
 		 723 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.13 
 
 		 1891 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 		 555 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  23.87 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 		 553 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.38 
 
 		 593 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  22.8 
 
 		 714 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.18 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.36 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 511 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  26.38 
 
 		 686 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  40.3 
 
 		 997 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  26.38 
 
 		 686 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  23.03 
 
 		 715 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  23.83 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  31.34 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  24.66 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24.42 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  25.32 
 
 		 711 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  26.43 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  21.27 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.18 
 
 		 1975 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.56 
 
 		 1942 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  22.19 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  24.16 
 
 		 544 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  25 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>