277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  100 
 
 		 479 aa  986    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  51.24 
 
 		 596 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  53.18 
 
 		 589 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  46.82 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  50.98 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  45.79 
 
 		 688 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  48.99 
 
 		 679 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  45.75 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  46.52 
 
 		 470 aa  385  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  45.78 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  48.34 
 
 		 914 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  44.01 
 
 		 722 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  42.5 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  42.57 
 
 		 563 aa  356  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  43.41 
 
 		 528 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  42.98 
 
 		 707 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  45.91 
 
 		 722 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  45.13 
 
 		 614 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  38.98 
 
 		 551 aa  317  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  41.31 
 
 		 1888 aa  316  7e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.04 
 
 		 2156 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  28.92 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  32.34 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.99 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.23 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.58 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.37 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  26.35 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  39.81 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  29.38 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.66 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  27.78 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  23.35 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  23.43 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  25.96 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.98 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  23.41 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.51 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  23.74 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  23.74 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  23.99 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  23.74 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  23.48 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.83 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  28.68 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  27.75 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  23.96 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  25.93 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  23.88 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 836 aa  58.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  22.58 
 
 		 1021 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.76 
 
 		 1891 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.42 
 
 		 462 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 814 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  24.59 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 624 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  24.4 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.82 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  23.05 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  26.78 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.16 
 
 		 507 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.46 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 521 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  25.45 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  23.64 
 
 		 527 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  29.1 
 
 		 554 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  23.17 
 
 		 694 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 604 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 725 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.26 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  30.59 
 
 		 725 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.82 
 
 		 925 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  24.67 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 571 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  28.48 
 
 		 739 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  31.65 
 
 		 558 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>