194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5195 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  100 
 
 		 707 aa  1443    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  54.01 
 
 		 738 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  49.23 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  45.53 
 
 		 722 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  46.54 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  42.42 
 
 		 596 aa  354  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  44.59 
 
 		 722 aa  347  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  43.96 
 
 		 589 aa  346  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  43.7 
 
 		 605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  42.98 
 
 		 479 aa  337  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  41.09 
 
 		 914 aa  336  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  43.64 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  41.67 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  42.24 
 
 		 688 aa  327  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  40.93 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  39.3 
 
 		 563 aa  303  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  35.78 
 
 		 612 aa  284  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  38.69 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  37.34 
 
 		 661 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  37.39 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.78 
 
 		 1888 aa  264  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.39 
 
 		 2156 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 453 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 		 453 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 		 458 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.17 
 
 		 1331 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 441 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  26.79 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  34.01 
 
 		 1401 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  24.72 
 
 		 449 aa  95.9  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  24.95 
 
 		 466 aa  95.1  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.78 
 
 		 1176 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.98 
 
 		 458 aa  94.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.25 
 
 		 1891 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  32.38 
 
 		 1401 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 1005 aa  90.9  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  24.15 
 
 		 449 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.59 
 
 		 1248 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  26.83 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.67 
 
 		 2068 aa  81.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.01 
 
 		 1975 aa  80.9  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  45.71 
 
 		 925 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.76 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  34.95 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  25.11 
 
 		 559 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  31.02 
 
 		 1017 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  20.65 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24.91 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.93 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  21.32 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  24.01 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.39 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  27.88 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 649 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  21.07 
 
 		 613 aa  62  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.29 
 
 		 1021 aa  61.6  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.67 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 1643 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  45.21 
 
 		 1307 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.9 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  21.63 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.5 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.73 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.24 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.84 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  24.54 
 
 		 442 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  23.83 
 
 		 631 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  21.67 
 
 		 752 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  22.92 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.95 
 
 		 526 aa  54.7  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 258 aa  54.3  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.17 
 
 		 2638 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.68 
 
 		 620 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 511 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.77 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.77 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  22.07 
 
 		 687 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  22.07 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  23.8 
 
 		 488 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.33 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  35.71 
 
 		 1025 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 493 aa  52  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 544 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  21.7 
 
 		 687 aa  51.6  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 554 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  23.55 
 
 		 472 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  26.19 
 
 		 552 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  23.33 
 
 		 477 aa  51.2  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>