21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2937 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  98.04 
 
 		 750 aa  1254    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 613 aa  1279    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  98.69 
 
 		 613 aa  1264    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  96.57 
 
 		 750 aa  1237    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  26.78 
 
 		 449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  26.05 
 
 		 449 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  26.48 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  25.37 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.81 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  21.63 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 614 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  21.83 
 
 		 1888 aa  51.2  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  19.47 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25 
 
 		 566 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  22.31 
 
 		 596 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  21.41 
 
 		 605 aa  43.9  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>