More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1302 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
541 aa  1110    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 
543 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  41.46 
 
 
551 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  41.85 
 
 
552 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 
552 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  39.78 
 
 
554 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 
560 aa  276  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  29.94 
 
 
590 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 
623 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
593 aa  174  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.13 
 
 
637 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  29.54 
 
 
990 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 
614 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.63 
 
 
607 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.25 
 
 
561 aa  149  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  41.33 
 
 
937 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  29.5 
 
 
876 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.47 
 
 
608 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.86 
 
 
618 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.34 
 
 
586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  28.66 
 
 
827 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.28 
 
 
587 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.83 
 
 
614 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  29.61 
 
 
854 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  28.74 
 
 
630 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.35 
 
 
621 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.68 
 
 
577 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.97 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.01 
 
 
610 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  29.86 
 
 
745 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.34 
 
 
581 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.4 
 
 
593 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.76 
 
 
605 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.23 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.69 
 
 
612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.16 
 
 
605 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.65 
 
 
653 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.61 
 
 
610 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.49 
 
 
592 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.53 
 
 
587 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  27.18 
 
 
818 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  26.9 
 
 
740 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  23.89 
 
 
848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  30.49 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 
958 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.4 
 
 
613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  24.36 
 
 
848 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  28.39 
 
 
754 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  38.03 
 
 
592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.12 
 
 
630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.64 
 
 
621 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  24.19 
 
 
850 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  29.82 
 
 
625 aa  126  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.35 
 
 
606 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  24.36 
 
 
852 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  26.85 
 
 
624 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  26.6 
 
 
640 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2784  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.81 
 
 
576 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.496519  normal  0.888452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.74 
 
 
642 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.65 
 
 
626 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  28.53 
 
 
640 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.2 
 
 
579 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3099  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.55 
 
 
578 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.42888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  24.19 
 
 
852 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  24.19 
 
 
852 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.64 
 
 
587 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.86 
 
 
640 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.67 
 
 
587 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
606 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3082  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.23 
 
 
580 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.79708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.23 
 
 
580 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal  0.16328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  28.22 
 
 
592 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.94 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.25 
 
 
640 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.48 
 
 
672 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  24.19 
 
 
852 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16640  maltooligosyl trehalose hydrolase  37.14 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.0825424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.58 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.94 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.45 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.84 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.56 
 
 
596 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.42 
 
 
588 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  26.73 
 
 
648 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  26.9 
 
 
716 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.81 
 
 
626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  25.48 
 
 
928 aa  120  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.41 
 
 
659 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.41 
 
 
659 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  27.05 
 
 
742 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.26 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  42.69 
 
 
618 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.69 
 
 
618 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.26 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.84 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  22.3 
 
 
1064 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.26 
 
 
594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.06 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  23.38 
 
 
852 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>