More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1129 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1129  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 767 aa  1564    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0646165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0100  alpha amylase catalytic region  59.49 
 
 		 802 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  37.25 
 
 		 720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  37.45 
 
 		 708 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  37.21 
 
 		 726 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  36.22 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  36.75 
 
 		 845 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  36.27 
 
 		 720 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  35.73 
 
 		 720 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  35.11 
 
 		 707 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  35.89 
 
 		 710 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  35.92 
 
 		 706 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  35.49 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  36.13 
 
 		 715 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  35.97 
 
 		 721 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  36.84 
 
 		 718 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  36.09 
 
 		 719 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  36.13 
 
 		 701 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  35.24 
 
 		 721 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  34.64 
 
 		 711 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  34.41 
 
 		 729 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  34.61 
 
 		 717 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  36.35 
 
 		 723 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  34.48 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  35.51 
 
 		 727 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  34.64 
 
 		 711 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  36.7 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  36.14 
 
 		 733 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  34.61 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  34.48 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  36.75 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  35.94 
 
 		 723 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  36.35 
 
 		 711 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  35.78 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  37.3 
 
 		 691 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  36.05 
 
 		 711 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  34.97 
 
 		 716 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  37.19 
 
 		 704 aa  364  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  34.9 
 
 		 719 aa  364  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  35.4 
 
 		 722 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  35.26 
 
 		 706 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  34.86 
 
 		 714 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  35.87 
 
 		 728 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  35.22 
 
 		 722 aa  363  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  35.18 
 
 		 716 aa  363  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  35.34 
 
 		 788 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  34.95 
 
 		 720 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  34.95 
 
 		 720 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  34.95 
 
 		 722 aa  361  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  36.98 
 
 		 720 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  35.6 
 
 		 752 aa  360  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  36.2 
 
 		 720 aa  360  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  36.19 
 
 		 706 aa  359  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  39.06 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  35.47 
 
 		 713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  35.01 
 
 		 751 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.37 
 
 		 1464 aa  358  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  35.66 
 
 		 714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  34.49 
 
 		 719 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  33.76 
 
 		 704 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  35.66 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  35.66 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  36.21 
 
 		 779 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  35.85 
 
 		 709 aa  356  6.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  36.26 
 
 		 738 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  35.26 
 
 		 758 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  35.26 
 
 		 758 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  35.12 
 
 		 1537 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  35.39 
 
 		 733 aa  356  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  34.97 
 
 		 701 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  34.48 
 
 		 715 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  35.31 
 
 		 733 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  35.82 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  33.25 
 
 		 718 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  36.27 
 
 		 720 aa  354  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  38.5 
 
 		 709 aa  354  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  35.7 
 
 		 712 aa  354  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  35.1 
 
 		 756 aa  353  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  35.14 
 
 		 755 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  35.83 
 
 		 738 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  35.31 
 
 		 730 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  36.23 
 
 		 779 aa  353  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  36.2 
 
 		 710 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  33.16 
 
 		 730 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  34.32 
 
 		 716 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  35.51 
 
 		 708 aa  350  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  35.56 
 
 		 709 aa  350  6e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  35.99 
 
 		 701 aa  350  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  37.66 
 
 		 701 aa  349  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  35.61 
 
 		 757 aa  349  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  35.48 
 
 		 745 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  34.81 
 
 		 712 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  35.74 
 
 		 707 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  34.55 
 
 		 712 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  34.71 
 
 		 705 aa  346  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  33.9 
 
 		 708 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  34.81 
 
 		 712 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  35.22 
 
 		 717 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  36.04 
 
 		 688 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  35.03 
 
 		 755 aa  343  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>