More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1848 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  100 
 
 
541 aa  1118    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.34 
 
 
554 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  45.42 
 
 
555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  44.53 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  44.53 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  43.69 
 
 
554 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  43.69 
 
 
554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  43.58 
 
 
554 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  43.51 
 
 
554 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  43.33 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  42.83 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  43.04 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  43.33 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  43.33 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  43.33 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  43.33 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  45.54 
 
 
551 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  45.65 
 
 
549 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  45.65 
 
 
549 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 
557 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 
562 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 
572 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  41.71 
 
 
568 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 
559 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  40.14 
 
 
556 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 
554 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.8 
 
 
556 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  41.05 
 
 
558 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  41.11 
 
 
558 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  41.11 
 
 
558 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  40.93 
 
 
558 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  41.11 
 
 
558 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  41.23 
 
 
558 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  41.11 
 
 
558 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 
558 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  40.87 
 
 
558 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  41.52 
 
 
562 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  41.48 
 
 
558 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  38.77 
 
 
578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  39.53 
 
 
560 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  41.19 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  39.64 
 
 
563 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.25 
 
 
546 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.57 
 
 
561 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.25 
 
 
546 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  42.71 
 
 
561 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  39.31 
 
 
582 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  40.46 
 
 
556 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 
577 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  40.28 
 
 
643 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.65 
 
 
560 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  42.74 
 
 
538 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  37.17 
 
 
570 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.27 
 
 
538 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.35 
 
 
560 aa  385  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.91 
 
 
560 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  37.52 
 
 
600 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  41.07 
 
 
622 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  40.76 
 
 
566 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.41 
 
 
562 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.9 
 
 
563 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  39.75 
 
 
553 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.32 
 
 
556 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  39.06 
 
 
596 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 
590 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.16 
 
 
531 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  38.69 
 
 
535 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  38.37 
 
 
557 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.1 
 
 
553 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  38 
 
 
556 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.3 
 
 
563 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.53 
 
 
562 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  37.37 
 
 
571 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 
552 aa  364  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  38.8 
 
 
606 aa  363  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  39.42 
 
 
536 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  40 
 
 
534 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  36.73 
 
 
557 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.1 
 
 
553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.1 
 
 
553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.1 
 
 
553 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  35.55 
 
 
577 aa  356  5.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.9 
 
 
553 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.9 
 
 
553 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.1 
 
 
553 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.81 
 
 
555 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.9 
 
 
553 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.9 
 
 
553 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  40.32 
 
 
639 aa  352  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.7 
 
 
553 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  37.78 
 
 
541 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.72 
 
 
561 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.93 
 
 
563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  38.15 
 
 
554 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 
549 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.25 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.27 
 
 
551 aa  340  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  37.27 
 
 
551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  37.27 
 
 
551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>