110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5658 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  59.93 
 
 
824 aa  968    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  100 
 
 
840 aa  1694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6727  hypothetical protein  39.34 
 
 
712 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.92 
 
 
756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  56.98 
 
 
672 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  53.47 
 
 
884 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.93 
 
 
1072 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.88 
 
 
815 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  56.99 
 
 
788 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  35.11 
 
 
1148 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.25 
 
 
962 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.79 
 
 
933 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  45.83 
 
 
622 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.09 
 
 
943 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  53.75 
 
 
3244 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  44.86 
 
 
2079 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.56 
 
 
674 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  57.35 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  60 
 
 
688 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  35.62 
 
 
726 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.5 
 
 
500 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.31 
 
 
494 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  48.98 
 
 
1016 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.57 
 
 
514 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  37.88 
 
 
547 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.97 
 
 
778 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.35 
 
 
489 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.05 
 
 
494 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  33.13 
 
 
1779 aa  62  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  37.12 
 
 
461 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  39.05 
 
 
794 aa  61.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.98 
 
 
482 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.75 
 
 
493 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  38.1 
 
 
737 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.37 
 
 
493 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  34.35 
 
 
566 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  49.53 
 
 
753 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.74 
 
 
507 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  27.22 
 
 
571 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32.43 
 
 
884 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  35.88 
 
 
380 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  27.23 
 
 
491 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  32.09 
 
 
806 aa  54.3  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  30.65 
 
 
427 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.34 
 
 
474 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.68 
 
 
510 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.56 
 
 
582 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 
503 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  34.65 
 
 
468 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  33.08 
 
 
472 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  31.06 
 
 
576 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.05 
 
 
1321 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  40.97 
 
 
518 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  31.72 
 
 
490 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.46 
 
 
957 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  35.11 
 
 
451 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.37 
 
 
487 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  40 
 
 
1338 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  37.78 
 
 
537 aa  51.2  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  30.61 
 
 
801 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.7 
 
 
503 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  50.79 
 
 
592 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.23 
 
 
691 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30.77 
 
 
664 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  39.08 
 
 
568 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  33.71 
 
 
483 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  43.28 
 
 
1991 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.81 
 
 
474 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.09 
 
 
498 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.48 
 
 
520 aa  48.9  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  38.46 
 
 
576 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
507 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.59 
 
 
2402 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.41 
 
 
2073 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  30.61 
 
 
573 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.15 
 
 
1413 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.96 
 
 
1139 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  34.15 
 
 
166 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.52 
 
 
597 aa  47.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.45 
 
 
472 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.23 
 
 
476 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  37.33 
 
 
672 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  39.47 
 
 
3563 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.15 
 
 
887 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1445  hypothetical protein  28.12 
 
 
368 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.06 
 
 
495 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  31.73 
 
 
436 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  35.63 
 
 
430 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30.88 
 
 
535 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38180  hypothetical protein  27.63 
 
 
486 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  40.68 
 
 
1869 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1577 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.66 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.69 
 
 
497 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  39.76 
 
 
603 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
423 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  32.67 
 
 
574 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  37.66 
 
 
748 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  50 
 
 
2802 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  30.23 
 
 
412 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>