70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7940 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1189    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  33.16 
 
 		 483 aa  194  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3861  hypothetical protein  40.25 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.09 
 
 		 737 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.38 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  24.89 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  28.77 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  30.46 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.27 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.56 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  30.61 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  30.52 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.65 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  21.95 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.86 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  21.95 
 
 		 800 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  21.95 
 
 		 805 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  21.95 
 
 		 800 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  21.95 
 
 		 858 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  21.95 
 
 		 858 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  21.95 
 
 		 858 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.11 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.76 
 
 		 756 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.32 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  30.67 
 
 		 563 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  30.5 
 
 		 576 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  29.15 
 
 		 963 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  27.4 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  27.46 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  30.83 
 
 		 691 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.09 
 
 		 493 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.22 
 
 		 537 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.91 
 
 		 982 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.66 
 
 		 863 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  33.12 
 
 		 401 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  33.68 
 
 		 748 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 1139 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  29.73 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.1 
 
 		 789 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.53 
 
 		 1072 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  31.69 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  26.21 
 
 		 1259 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  27.21 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  26.57 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 172 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 1413 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  27.69 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.32 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.48 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.71 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  30.61 
 
 		 840 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  26.09 
 
 		 1207 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  27.74 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.03 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 943 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  25 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.07 
 
 		 1016 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 647 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.17 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>