153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6294 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 427 aa  865    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  46.04 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  42.91 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 		 907 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 686 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.86 
 
 		 883 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 1321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.72 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  34.17 
 
 		 281 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.19 
 
 		 627 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  37.39 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 		 641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 		 642 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  40.31 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  41.29 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  40.53 
 
 		 289 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  36.65 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.52 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.76 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  33.2 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  38.14 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  36.94 
 
 		 279 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.75 
 
 		 288 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.75 
 
 		 1290 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  34.5 
 
 		 276 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.95 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.96 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  39.22 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.93 
 
 		 1059 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  36.82 
 
 		 842 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.86 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  34.47 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.48 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.73 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.5 
 
 		 742 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  38.92 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  34.62 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  30.11 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  38.57 
 
 		 287 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 		 1332 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.74 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 		 284 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.2 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.12 
 
 		 912 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  31.69 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.96 
 
 		 330 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.9 
 
 		 1694 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.68 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.9 
 
 		 884 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  38.86 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  27.27 
 
 		 1028 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31 
 
 		 290 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.31 
 
 		 569 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.08 
 
 		 532 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  33.18 
 
 		 271 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 694 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  28.52 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  33.16 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.86 
 
 		 819 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  36.42 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.05 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  37.58 
 
 		 238 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  32.97 
 
 		 275 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  30.58 
 
 		 277 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  29.83 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.03 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.38 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.78 
 
 		 1441 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  38.58 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.82 
 
 		 595 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  32.7 
 
 		 691 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.76 
 
 		 1707 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  36.24 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  31.25 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 752 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.01 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  36.59 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  34.25 
 
 		 808 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.39 
 
 		 693 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  29.3 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  32.12 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.9 
 
 		 1918 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  30.65 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>