120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1608 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 
306 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  56.16 
 
 
315 aa  318  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.67 
 
 
328 aa  309  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  50.87 
 
 
291 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.32 
 
 
532 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  46.96 
 
 
694 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.74 
 
 
358 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.31 
 
 
884 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.8 
 
 
912 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.56 
 
 
742 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  38.49 
 
 
1918 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 
1321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.71 
 
 
633 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.84 
 
 
409 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.08 
 
 
328 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  38.7 
 
 
301 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  39.35 
 
 
276 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36 
 
 
503 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  37.85 
 
 
274 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  36.48 
 
 
279 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36.3 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.29 
 
 
288 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.11 
 
 
1694 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 
556 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  37.77 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.55 
 
 
389 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.87 
 
 
383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.28 
 
 
282 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  36.56 
 
 
286 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
642 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
641 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.11 
 
 
283 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.46 
 
 
426 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 
291 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.91 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.56 
 
 
1290 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.85 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  33.45 
 
 
883 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.09 
 
 
627 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.02 
 
 
1441 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.66 
 
 
547 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  39.42 
 
 
238 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  35.89 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 
1332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.81 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.6 
 
 
1059 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.05 
 
 
588 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.75 
 
 
290 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  31.7 
 
 
1028 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
752 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.88 
 
 
569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.13 
 
 
819 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  30.71 
 
 
286 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
427 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  29.83 
 
 
275 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  28.47 
 
 
313 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.71 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  29.35 
 
 
319 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  30.19 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.33 
 
 
467 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
384 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 
907 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.17 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  30.07 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.15 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
608 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.33 
 
 
477 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.37 
 
 
479 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  25.81 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  25.53 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.37 
 
 
722 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.98 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  28.47 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  24.9 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  24.43 
 
 
1707 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  28.08 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  28.89 
 
 
470 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.7 
 
 
464 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.11 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
686 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  25.6 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  29.87 
 
 
539 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.94 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  31.22 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.06 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.02 
 
 
915 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
492 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  25.94 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  28.37 
 
 
388 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  25.26 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>