65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2950 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  93.33 
 
 
300 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  92.96 
 
 
300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  50.36 
 
 
291 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 
556 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  33.01 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  27.6 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  24.41 
 
 
628 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.64 
 
 
633 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  36.07 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.49 
 
 
547 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.94 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.97 
 
 
884 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  26.94 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  25.75 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.56 
 
 
722 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.01 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.16 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  29.17 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
752 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  27.17 
 
 
486 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  23.6 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.17 
 
 
912 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  27.01 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.63 
 
 
819 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.19 
 
 
1441 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.37 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  27.2 
 
 
691 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
427 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  26.8 
 
 
467 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  24.59 
 
 
475 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  28.37 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
1321 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25.5 
 
 
389 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
1332 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  32.45 
 
 
842 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  27.1 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  22.89 
 
 
1918 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  24.7 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.05 
 
 
1290 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  28.31 
 
 
294 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.23 
 
 
627 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.52 
 
 
1694 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
384 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  30.08 
 
 
426 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  26.98 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  25.47 
 
 
283 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  27.75 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.98 
 
 
883 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  28.08 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.29 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  27.07 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.18 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  24.39 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 
1166 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 
346 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>